Все зависит, находится ли квартира в собственности Вашего брата.
Если да - то тогда подается иск о снятии с регистрационного учета по месту жительства, вот и все. Наличие другого жилья в этом случае суд не интересует и не имеет для него значения.
Продолжение: тогда начинайте с муниципалитета. Поставьте их в известность, что человек не живет долгое время. В этом случае (квартира муниципальная) в суд вправе обратиться они.