Уважаемая Юлия!

Если Вы с детьми добровольно сниметесь с регистрационного учета (по вашему прописка), то Вы с детьми потеряете право на приватизацию квартиры и тогда сестра станет единственным собственником квартиры в порядке приватизации.
Захочет ли она обратно потом Вас с детьми зарегистрировать в эту квартиру, то это ёё право, а не обязанность.

Что касается снятия Вас с детьми с регистрационного учета в этой квартире в судебном порядке,то ответить в настоящее время на этот вопрос не представляется возможном, поскольку необходимо ознакомиться со всеми имеющимися у Вас по этому поводу документами и дополнительной информацией.
По этому вопросу я бы Вас посоветовал обратиться к адвокату на очную консультацию.

Буду признателен за положительный отзыв.