Наследовать можно только то имущество, которым владел наследодатель. Объекты недвижимости считаются находящимися в собственности с момента госрегистрации. Если нет госрегистрации - нет права собственности. Но наверное наследодатель пользовался этим земельным участком и до подачи документов на регистрацию. Если да - то Вам в заявлении нужно указать не право собственности а право пользования и владения.
Согласно ст. 209 ГК собственность -- это отношение лица к принадлежащей ему вещи как к своей, которое выражается во владении, пользовании и распоряжении ею, а также в устранении вмешательства всех третьих лиц в сферу власти собственника. Без регистрации нет права собственности.

Владение -- фактическое обладание вещью, под которым понимается прежде всего субъективное право на защиту объекта собственности от посягательств третьих лиц. Этим обладал наследодатель

Пользование -- извлечение из вещи полезных свойств путем ее потребления в производственных или бытовых целях. может быть он обрабатывал этот участок или сажал что-либо

Распоряжение -- совершение в отношении объекта собственности действий, определяющих его судьбу таких как отчуждение, сдача внаем, залог и т. д. вплоть от уничтожения. Этот вид только после получения права собственности.

Если нотариус откажется включить зем.участок в наследственную массу - в этом случае Вы имеете право устанавливать Ваше право в судебном порядке и просить суд признать за Вами право собственности в результате наследования зем.участка, которым был во владении и использовании умершего наследодателя.