Добрый день! Обычно вопросы личной жизни сотрудников регламентируются деловой этикой конкретной организации. Вы служите гос. органе и мне с трудом верится, что в Вашей структуре такие ограничения имеются.
В любом случае, при неформальной неприязни близких родственных связей Вы всегда сможете перевестись на смежную должность в той же самой структуре, так чтобы Ваш муж не был ни Вашим фактическим руководителем, ни руководителем через 1-2-3 звена.
Семья на первом месте как ни крути))) Поэтому выбирая мужа, не думайте о последствиях.