Оценивать часть квартиры будут оценщики. В будущем если Вы не будете выплачивать кредит, банк подаст в суд, в суде кроме к сумме кредита с процентами прибавятся пени за просрочку уплаты кредита и судебные расходы. После этого исполнительный лист будет передан приставам, те в свою очередь поднимут судебный долг еще на 6% и после этого начнут искать Ваше имущество, т.е. автомобили, счета в банках и прочее.
Выбранный Вами вариант не очень хорош в перспективе.
Если желаете продать часть квартиры, то понижайте цену (при этом Вам предварительно придется предложить выкупить по данной цене иным собственникам).