Здравствуйте!
Возможно, нужно обратиться за разъяснениями к самому работодателю (возможно вы не учитываете НДФЛ, в размере 13%, который работодатель уплачивает за вас, будучи налоговым агентом). Пусть ответит в письменной форме с приложением расчётного листа за соответствующий месяц. Если, действия неправомерны, обратитесь в суд.